吉林省农科院于2003年12月，被国家人事部批准设立博士后科研工作站，2006年被批准为吉林省博士后科研创业基地，2008年，经我院积极争取，省人社厅大力支持和帮助，全国博士后管理协调委员会批准我院单独招收博士后研究人员，并更名为“中国农业科技东北创新中心博士后科研工作站”。建站以来，共招收博士后97人，其中留学回国博士后13人，联合招收和培养博士后7人。已办理出站手续77人。目前在站博士后20人。

我院对博士后科研工作站工作给予高度重视，把博士后工作纳入人才工作总体规划，加强宏观指导和管理，不断加大支持力度。建站伊始，成立了博士后科研工作站领导小组和管理办公室，制定了《中国农业科技东北创新中心博士后科研工作站管理办法》，明确进站、在站、出站管理规范。制订博士后招收、开题、经费管理、项目管理、中期检查、出站评审、公寓管理等制度，构建了博士后研究选题、开题报告、中期考核、出站报告评价标准体系。加强博士后工作站建设，投资30万元在省博士后公寓长期租用3套博士后公寓（租用期限30年），全部达到提包入住、家庭办公条件，投资100多万元装修4套博士后公寓，较好的解决了博士后研究人员的居住问题，为博士后研究人员开展工作建立了优良的工作环境和秩序。

为加强博士后科研工作，我院设立了“博士后科研资助资金”，用以资助博士后人员开展科研工作。目前，工作站已为博士后提供专项资金资助近300万元。同时积极组织争取省和国家博士后资金资助，有61人获得省博士后专项资金资助489万元；有11人获得国家博士后基金面上资助48万元。建立了博士后科研经费专用账户，统一管理，单独设账，专款专用。

几年来，在国家和省博士后管委会的关怀与支持下，我院博士后科研工作站取得了可喜的成绩，博士后研究人员队伍不断壮大，创新能力有很大提高。2009年，在人社部博士后科研流动站和工作站评估工作中，我院博士后工作站名列吉林省前茅；2010年，作为国家人力资源和社会保障部“纪念博士后制度设立25周年表彰大会”优秀博士后工作站遴选对象参加评估，获得良好等级。2012年，被评为吉林省先进博士后工作站，有4名同志分别获得优秀合作导师、研究人员、管理人员荣誉。2015年，我院博士后科研工作站在全国博士后综合评估中荣获优秀等级，1人荣获优秀博士后管理工作者。